根據《中華人民共和國發票管理條例》的規定，苗木免稅普通發票是合法的稅收憑證，并可以申請抵扣。可以在企業稅務登記機關進行申請辦理，向企業稅務機關出具申請材料，可以以苗木免稅普通發票作為申請抵扣憑據，抵扣稅額最高為當次本期應納稅額之和。 拓展知識：抵扣具有稅收減免功能，可以在當期應納稅款中減免一部分稅款，進而減輕企業的負擔。可以通過減稅、免稅或稅費減免等方式實現抵扣，也可以通過其他方式給予稅收減免政策，對滿足一定條件的企業申請抵扣稅收。