若發票金額大于付款金額，應當先核實貨物數量、價格及稅額是否填寫正確。若開票的信息存在誤差，則需要更改發票上的貨物數量、價格及稅額，以使發票金額等于付款金額。若發票貨物數量、價格及稅額填寫正確，但發票金額仍大于付款金額，應當妥善處理以免出現雙重付款，以免發生財務損失。 一般情況下，專票可以按實際開票稅額全部抵扣，但前提是完成了抵稅憑證的發放，且發票金額應仍大于付款金額。另外，有些公司會建立一套分步記賬模式，當發票金額大于付款金額時，可以申請臨時現金支付出賬，然后當抵稅憑證發放時再把臨時現金賬戶的款項歸還到現金賬戶，這樣可以避免雙重付款的情況發生。 拓展知識：在結賬過程中，如果開票人只收款而不開票，則必須要求該企業給予收據，并進行賬務處理，以（一般）50%的稅率向稅務機關申報，這是為了降低稅收負擔。