在考慮到合理性上來說，不建議由分公司開發票收款，具體原因如下： 一是，有關開發票的會計制度較復雜，許多政府機關的補貼和支出不能通過該方式完成，許多記帳處理也不適用； 二是，審計不易，對于經營收款的審計將變得更加復雜，特別是企業的內部審計； 最后，由分公司開發票收款可能會造成一些安全問題，比如稅務稽查、安全審計等。 拓展知識： 為了減少收款的風險，可以采取分公司收款，由總公司開發票的方式。這種方式具有較高的合規性，可以減少風險，同時可以有效審計財務狀況，減少內部審計成本。