處理增值稅發票聯丟失可以按照《增值稅暫行條例》及相關稅務機關的規定辦理。 一般來說，當發票聯被遺失的，可以持有發票的購貨方向增值稅納稅申報表的開票方申請補開發票聯。補開發票聯的，應由增值稅稅務機關登記備案，及時修改增值稅納稅申報表，套打發票時帶有原發票聯的信息完整。 此外，如果發票聯被遺失，則購貨方還可以拿出原發票、購貨合同及其它有關憑證，向增值稅稅務機關申請補開發票聯，并且相關稅務機關出具補開發票聯的相關證明文件。 其拓展知識： 發票聯的遺失也會帶來一定的法律后果，如發票聯被遺失、發票聯與實際發票信息不符等情況，可能導致購貨方因沒有發票聯而遭受稅務機關誤罰等情況發生。因此，購貨方和開票方應及時補開發票聯，把發票聯和發票綁定，以避免不必要的納稅糾紛。