是的，辭退該員工后，公司可以從他的工資里扣除借款，但需要遵循一定的程序。首先，經(jīng)理應(yīng)按照有關(guān)規(guī)定通知該員工，待該員工確認此書，并簽字接受后，公司才可收回借款。同時，公司必須確保財務(wù)報表能夠直接證明，該借款來自該員工的工資，并且扣除的金額為該員工拖欠的金額。此外，依據(jù)《勞動合同法》規(guī)定，工作單位有權(quán)從勞動者的工資、獎金中扣除勞動者債務(wù)欠款，但其扣除比例不得超過當月工資總額的50％，扣除方式須按照有關(guān)單位核定的債務(wù)清償計劃執(zhí)行，不得超越其規(guī)定的限度。 拓展知識：如果該員工拖欠借款，一般都會有對應(yīng)的《借款合同》，在員工被辭退前，可將該《借款合同》明確地顯示給被辭退員工，讓其知悉自己確實有借款，并由其簽字確認，以此作為公司從被辭退員工工資中抵扣借款的法律依據(jù)。