一般納稅人在填寫增值稅申報表時發票上開具6%稅率的咨詢費應填寫在3.6.2欄中，即金額扣除項目中的服務、不動產和無形資產及其他收入項目欄，填寫時要注意，有的地方發票分類較多，有的費用辦理過程中被分為多項，這些都需要按照實際情況填寫，但最終都需要在金額扣除項目中加起來，填寫到本表第3.6.2欄中。另外，在填寫稅費申報表時，一般納稅人還應注意稅收減免和稅務協定的適用，例如有的收入可以享受減免的稅收，有的收入可以按照稅務協定征收稅收，這些都需要納稅人了解。