是可以扣除的。企業給員工購買重大疾病險，作為住房公積金抵稅憑證之一，是可以納入住房公積金抵稅范疇中的。可扣除項目包括公積金，重大疾病險，商業保險，年金，以及其他住房支出等。具體可扣除金額有所限制，一般每戶只能扣除相關支出的最高金額2500元。 拓展知識： 住房公積金抵稅是指納入住房公積金抵稅范疇中的繳納住房公積金及其符合評定條件的相關支出，包括公積金，重大疾病險，商業保險，年金，以及其他住房支出等。此外，住房公積金抵稅還可以減免個稅，即抵扣已交納的住房公積金,以減免當期應交稅費金額。