小規模企業開具增值稅專用發票的稅率為3%。根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》（2013年修訂）第四十二條，分別以3%、1.5%和1%收取增值稅，對小規模納稅人開具的增值稅專用發票計征稅率為3%。實行小規模納稅人免征增值稅的，應當在確定稅務登記信息準確無誤的情況下，建立小規模納稅人免征增值稅的政策，小規模納稅人應當開具增值稅專用發票，增值稅以3％計征。 拓展知識：對于企業開具增值稅專用發票，稅率可以按照國家規定分為3%、1.5%和1%三種，具體稅率根據不同企業的納稅依據而定，小規模納稅人免征增值稅可以申請納稅服務廳免稅。企業在開具增值稅專用發票時，要認真核對納稅人識別號，將折扣征收稅率和稅額等信息準確無誤地核實，以確保專用發票的正確開具。