現在的發票抵扣勾選時間主要受到企業收發票和稅務機關開具發票之間的時間差影響，一般情況下，稅務機關在收到企業開具發票申請后，經過審核可以在三個工作日之內開具發票，發票開具之后，企業可以通過稅控平臺進行抵扣勾選，抵扣勾選的時間受到發票到達企業的時間影響，一般情況下，發票到達企業后，企業可以在兩個工作日內完成抵扣勾選。因此，發票抵扣勾選的總時間一般為5個工作日。 此外，為了更好地服務企業，部分財政局地已經建立了稅控平臺，這樣一來，即便企業拿不到實體發票，稅收機關也可以通過稅控平臺將發票信息傳輸至企業的電腦，由企業自行完成發票抵扣勾選，這樣可以顯著縮短發票抵扣勾選的總時間，為企業創造更多價值。