企業在更新改造固定資產時領用的工程物資的進項稅額可以在工程物資直接參與到改造固定資產的建造，投入使用的過程中抵扣稅款。若是領用的工程物資沒有及時投入到更新改造固定資產的建造，投入使用的過程中，進項稅額就不能作為稅款抵扣申請，而是要在銷售稅額轉出時處理，在貨物發出之后分攤到下次購置貨物作為準備金，并在完成轉出后，結合本次購買的工程物資和參與改造的固定資產的本次支出，同時作為本次可以抵扣稅額的基礎。 另外，在購進工程物資的進項稅額轉出后，還應該通過合理設置收費項目，避免把全部稅款都抵扣完，同時，還可以讓企業適時向稅務機關申報稅款抵扣，以減輕工程物資稅款抵扣對財務成本帶來的影響。 總之，企業在更新改造固定資產時領用的工程物資的進項稅額應該及時轉出，以便實現及時抵扣稅款。拓展知識： 除了抵扣稅款，企業在更新改造固定資產時還可以向政府申請稅收優惠政策，以幫助企業更好地實現更新改造目標，減輕企業財務成本，或者爭取政府補貼資金等政府支持政策，以及結合企業會計核算，實現合理的工程物資管理。