在有進項和留底稅額時，加計扣除計算應以本期實際發生稅費為準。即首先以上期留底稅額為基礎，將本期新增發生稅費加進去；然后再結合本期發生的進項稅費，分別減去可以加計扣除的增值稅額，得出本期可加計扣除的增值稅額。 例如：本期進項稅額為1000元，上期留底稅額為2000元，本期新生成稅額為500元，可加計扣除的增值稅額為：1000+500-2000=500元。 一般建議企業在繳納稅款前，先采取留底計算的方法來確定自身可加計扣除的增值稅額，以免漏繳稅款或者繳納過多稅款。 除了用留底計算和進項計算來確定可加計扣除的增值稅，其實也可以根據《增值稅企業所得稅稅前扣除辦法》的相關規定，對一些具體情況進行特殊加計扣除，避免因不熟悉規定而造成稅費的損失。