增值稅專用發票的抵扣聯可以單獨保管，也可以放入憑證和發票聯一起存放，一般企業將增值稅專用發票的抵扣聯與憑證聯或發票聯存放在一起，以便查閱及審核用。保存時可以采取按日期存放、按類別存放、按月份存放等方式存放。此外，增值稅專用發票還有辦稅人員抵扣聯和校驗碼。辦稅人員抵扣聯用于專用發票的交易信息備案，打印完整的校驗碼在購貨方發票領貨及實際使用上有一定的參考作用，可以防止發票被篡改。拓展知識：憑證聯主要是指發票的購貨方、銷貨方、金額等信息，是發票信息的絕對準確的承諾，如果憑證聯存在錯誤，會影響發票的使用。