是的，在單位將專利轉讓給其他公司時，可以開具免稅發票。免稅發票，也稱出口發票或增值稅專用發票，是增值稅征收中使用的獨特票據，有利于出口企業申報退稅。但開具發票前是需要先做備案的，備案手續一般是到稅務局去辦理，依據不同地區的不同政策，可能會要求提供營業執照、稅務登記證、組織機構代碼證等相關證明文件。備案完成后，稅務機關會出具備案證明，只有擁有此證明方可開具免稅發票。此外，在每張發票中還要額外注明轉讓專利信息，即被轉讓專利的名稱、編號及轉讓日期，以便稅務機關審計與查證。 拓展知識：稅務機關審計給予的憑證重要性，企業需要注意準確填寫發票，只有準確提供相關財務資料，稅務機關才能完成審核，并給予退稅。此外，稅務憑證的保存期也非常重要，做稅務憑證的保留期是一年，超過一年的憑證就不能辦理退稅，如果企業存有超過一年以上的憑證，需要盡快結算。