入賬，借，庫存商品，貸，銀行存款，然后期末銷售的正常結轉商品成本？借，主營業務成本，貸，庫存商品，那不允許稅前扣除在哪一步操作？

是在你匯算清繳的時候填表操作的。

平時季度申報，也就是預繳的時候，相當于是把這些成本扣除了，然后等到次年匯算清繳的時候，再調增補繳，是這個意思嘛

對的，沒錯，就是這個意思。