居民個人以計算機軟件著作權(quán)投資的個人所得稅有三種繳納方式。一是在投資時一次性繳納，以投資確認價值減去該計算機軟件著作權(quán)的原值和合理稅費后的差額確認為所得，按財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得適用稅率20%計算繳納個人所得稅；二是分期確認所得繳納，以投資確認價值減去該計算機軟件著作權(quán)的原值和合理稅費后的差額確認為所得，合理確定分期繳納計劃報主管稅務(wù)機關(guān)備案后，自發(fā)生投資行為之日起不超過5個公歷年度內(nèi)分期繳納個人所得稅；三是遞延到股權(quán)轉(zhuǎn)讓時繳納，經(jīng)向主管稅務(wù)機關(guān)備案，投資入股當(dāng)期暫不納稅，遞延到轉(zhuǎn)讓股權(quán)時，按股權(quán)轉(zhuǎn)讓收入減去該計算機軟件著作權(quán)的原值和合理稅費的差額計算繳納個人所得稅。無論居民個人采取何種方式繳納個人所得稅，均不影響所投資的軟件企業(yè)對接受投資的計算機著作權(quán)計價和企業(yè)所得稅處理，即以該計算機軟件著作權(quán)投資入股的評估值作為其計稅基礎(chǔ)，按無形資產(chǎn)稅前扣除規(guī)定在企業(yè)所得稅稅前攤銷扣除。