1、增值稅不需要進行進項稅額轉出處理。 《增值稅暫行條例實施細則》第二十四條規定，條例第十條第（二）項所稱非正常損失，是指因管理不善造成被盜、丟失、霉爛變質的損失。 參照《安徽省國家稅務局關于若干增值稅政策和管理問題的通知》（皖國稅函〔2008〕10號）*9條第（二）項規定，納稅人因庫存商品已過保質期、商品滯銷或被淘汰等原因，將庫存貨物報廢或低價銷售處理的，不屬于非正常損失，不需要作進項稅額轉出處理。 2、《企業資產損失所得稅稅前扣除管理辦法》（國家稅務總局公告2011年第25號）第五條規定，企業發生的資產損失，應按規定的程序和要求向主管稅務機關申報后方能在稅前扣除。未經申報的損失，不得在稅前扣除。 第九條規定，下列資產損失，應以清單申報的方式向稅務機關申報扣除： （一）企業在正常經營管理活動中，按照公允價格銷售、轉讓、變賣非貨幣資產的損失； （二）企業各項存貨發生的正常損耗； …… 第十條規定，前條以外的資產損失，應以專項申報的方式向稅務機關申報扣除。企業無法準確判別是否屬于清單申報扣除的資產損失，可以采取專項申報的形式申報扣除。 第二十七條規定，存貨報廢、毀損或變質損失，為其計稅成本扣除殘值及責任人賠償后的余額，應依據以下證據材料確認： （一）存貨計稅成本的確定依據； （二）企業內部關于存貨報廢、毀損、變質、殘值情況說明及核銷資料； （三）涉及責任人賠償的，應當有賠償情況說明； （四）該項損失數額較大的（指占企業該類資產計稅成本10%以上，或減少當年應納稅所得、增加虧損10%以上，下同），應有專業技術鑒定意見或法定資質中介機構出具的專項報告等。 根據上述規定，藥品存貨過期報廢銷毀損失屬于應以專項申報方式向稅務機關申報扣除的損失，損失數額較大的，應有專業技術鑒定意見或法定資質中介機構出具的專項報告等。