出口企業去主管稅務機關進行出口退稅預申報，提示非交叉稽核相符發票疑點，說明國稅部門的出口退稅審核系統沒有收到增值稅專用發票交叉稽核信息。　　如果排除不屬于進貨明細申報數據錄入錯誤，可填寫《出口企業信息查詢申請表》將缺失對應憑證管理部門電子信息或憑證的內容與電子信息不符的數據和原始憑證報送至主管稅務機關，由主管稅務機關協助查找相關信息。主管稅務機關如果查詢電子數據傳輸系統有電子信息，可由主管稅務機關通過出口退稅審核系統運維上報市局、省局運維處理，來幫助企業查詢讀入增值稅專用發票交叉稽核信息。