連鎖藥店的話怎么建賬呢？好幾十家店，每個店利潤單獨核算怎么建賬

那你就每一個獨立的門店單獨建一套帳，然后期末的時候編制合并報表。

這款軟件中的部門功能怎么用？能算每個門店的利潤么？

這個部門功能，它只是說在某些費用分攤的時候，可以分攤到每一個部門兒，這個實現不了你這個獨立。