員工自己墊錢，從我們公司給他繳納住房公積金

這個不算你們的費用。

打進錢：借：銀行存款 貸：其他應收款-A 支出公積金：其他應收款-A 貸：銀行存款 ，這樣做是對的嗎？

如果是先打錢的話，就計入到其他應付款里面。