那如果項目經理不想提供查賬征收部分的成本發票，想拿走這部分利潤，應該怎么處理？要開發票嗎？按什么比例收取個人所得稅？

那就扣除你單位全部繳納的稅款之后給他 也就是所得稅安收入繳納

這部分項目經理不需要開票是嗎？這個按勞務報酬給他報個稅還是工資薪金？

它屬于你單位的職工，你們給他交社保的情況下，可以按照工資來。

他不是職工，怎么處理？需要去稅務局開勞務票，然后公司代扣代繳個人所得稅嗎

你們可以給他申報勞務報酬，沒有發票的，他不給提供發票的，不抵扣所得稅，從他工程里面扣除就行。