1、獨立核算和非獨立核算企業會計核算的兩種形式，不屬于稅務機關的規定，并不是說獨立核算就要在分公司主管稅務機關納稅，非獨立核算就不需要在分公司主管稅務機關納稅。 獨立核算是指對本單位的業務經營活動過程及其成果進行全面、系統的會計核算。獨立核算單位的特點是：在管理上有獨立的組織形式，具有一定數量的資金，在當地銀行開戶；獨立進行經營活動，能同其他單位訂立經濟合同；獨立計算盈虧，單獨設置會計機構并配備會計人員，并有完整的會計工作組織體系。 非獨立核算又稱報帳制，是把本單位的業務經營活動有關的日常業務資料，逐日或定期報送上級單位，由上級單位進行核算。非獨立核算單位的特點是：一般由上級拔給一定數額的周轉金，從事業務活動，一切收入全面上繳，所有支出向上級報銷，本身不單獨計算盈虧，只記錄和計算幾個主要指標，進行簡易核算。 2、企業成立分公司，流轉稅一般在分公司所屬稅務機關申報交納，所得稅在總公司匯算清繳，與分公司獨立核算和非獨立核算無關。分公司應建賬，以便于進行納稅申報；分公司先編制報表交總公司匯總進行報表的編制。 3、如果分公司不單獨建賬，則需要總公司在所建賬中，按不同的分公司進行內部核算。 4、分公司如果單獨建賬，發生的費用取得發票名稱應為分公司，如果分公司不單獨建賬，發生費用取得的發票名稱應為總公司。 5、工資和社保可以在總公司直接支付，也可在分公司，個稅的代扣主要看工資由誰來發放。 6、如果工資在異地分公司發放，則需要在分公司所在地繳納社保。同時因為分公司一般需要在所在地繳納增值稅及附加，所以，一般情況下分公司都需要開立銀行賬戶，否則無法進行納稅申報。