老師，購買方和銷售方都沒有強制規定用基本戶嗎

是的，沒有強制規定的

老師，老板有兩個公司，甲公司員工社保都是從乙公司交，個人部分，從甲公司工資扣除，怎么做賬。

這樣就不合適了，顯得非常亂。要全部統一到一個公司處理。不然本身就會有稅務風險的。