注意事項： 1、開發間接費問題： (一)開發間接費用應是房地產開發企業直接組織、管理各開發項目實際發生的費用，行政管理部門、財務部門或銷售部門等發生的管理費用、財務費用或銷售費用不得列入。 (二)開發間接費用與開發費用中的管理費用應按照有關企業會計準則或企業會計制度的規定區分并分別核算。如劃分不清的，全部作為房地產開發費用，按規定的比例計算扣除。 (三)房地產開發企業同時開發不同房地產項目時，根據受益的項目扣除的開發間接費用應是各房地產項目直接發生的實際支出并取得合法有效憑證的費用。 2、商住一體清算問題： 開發項目中同時包含普通住宅和非普通住宅的，應分別計算增值額。盡管立項時是一個項目，但計算土地增值稅時需要分為兩個項目進行清算，收入及相應稅金完全可以分開計算，至于相關成本如何扣除，國稅發[2006]187號文件第四條第(五)項規定，屬于多個房地產項目共同的成本費用，應按清算項目可售建筑面積占多個項目可售總建筑面積的比例或其他合理的方法，計算確定清算項目的扣除金額。 3、利息費用問題：房地產開發企業向銀行貸款使用的借據(借款合同)、利息結算單據等，都可以作為金融機構證明對待。此類利息支出，凡能夠按房地產項目計算分攤并提供金融機構證明的，允許據實扣除，但最高不能超過按商業銀行同類同期貸款利率計算的金額。其他房地產開發費用，以按規定計算的土地和房地產開發成本金額之和的5%計算扣除。開發項目未發生利息支出的，房地產開發費用以按規定計算的土地和房地產開發成本金額之和的5%計算扣除。