一、所用會計科目不同 　　在處理同一業務時，事業和企業單位所做的會計分錄形式相同，借貸方向相同，但因不同制度所規定的會計科目名稱不同而將有關內容分別記入不同的賬戶。如借款的核算，在借入時，企業按期限長短分別記入“短期借款”或“長期借款”科目，而事業單位則不分長期或短期借款，一概記入“借入款項”科目。 　　二、因單位性質賬務處理方法不同 　　1、因是否從事產品生產而導致的差異。這類差異應分兩種情況，一是要區別從事產品生產的事業單位和不從事產品生產的事業單位在賬務處理上存在差別，要區別對待。二是同樣從事產品生產，事業單位與企業單位在賬務處理上仍有差異。以材料采購業務為例。企業的做法分一般納稅人和小規模納稅人兩種，前者在購入時采用不含稅進價，以區分進項稅額；后者則采用含稅進價。