沖減是填在申報表哪里呢？

就是正常填銷售額和稅額的那欄，你按沖減后的數填進去。

這樣的話，開票系統收入數據與申報表不一致，能申報成功不？

如果對未開票收入在日后開具發票，則對開具發票期間，申報增值稅不能在“未開票收入”填列負數，而應計算在開票銷售額中減去已經申報的未開票收入，將差值填列到“開票收入”的相應欄次。 對于因此操作而產生的比對異常，因為不能在網上申報，需要按照主管稅務機關要求接受審核，并提交相應的證據證明該項差額與以前期間申報的未開票收入金額的一致性，申請正常申報和解鎖稅控設備。