可以報稅，因成本核算方法變更合理合法且費用真實，有正當理由。但被稅務稽查可能性較大，金稅三期對超 50% 的主營業務成本預警會引起稅務機關關注，不過若能準備好變更資料及相關憑證等向稅務機關說明情況，也可能不會被深入檢查。