注冊會計師審計和內部審計是兩種不同的審計方式，其主要區別如下：
1. 審計目的不同：注冊會計師審計是為了對公司的財務報表進行審計，以確定其是否真實、準確、完整地反映了公司的財務狀況；而內部審計則是為了評估公司的內部控制制度是否有效，并提出改進建議。
2. 審計主體不同：注冊會計師審計由獨立的外部審計師進行，其獨立性和客觀性得到保障；而內部審計則由公司內部的審計人員或部門進行，其獨立性和客觀性可能受到公司內部的影響。
3. 審計報告不同：注冊會計師審計生成的審計報告是向公司的股東、債權人、監管機構等外部利益相關方公開的，其內容包括審計師對公司財務報表的審計意見、審計程序和發現的問題等；而內部審計則向公司內部管理層提供審計報告，其內容包括對公司內部控制制度的評估和提出的改進建議等。
4. 審計時間不同：注冊會計師審計通常在公司財務報表公布后進行，以確保報表的準確性；而內部審計則可以隨時進行，以及時發現公司內部控制制度的問題并提出改進建議。

總之，注冊會計師審計和內部審計都是對公司財務狀況進行審計的重要手段，但其審計目的、審計主體、審計報告和審計時間等方面存在明顯的區別。