行政事業單位預算編制程序一般包括以下步驟：
1. 制定預算編制工作方案：確定預算編制的時間表、任務分工、預算編制的原則和要求等。
2. 進行預算調研：收集和分析行政事業單位的財務和經濟數據，了解單位的收支狀況、資產負債情況、經濟運行狀況等。
3. 制定預算指標：根據預算編制原則和要求，制定預算指標。預算指標應該具有可操作性、可比性、可控性、可評價性等特點。
4. 編制預算草案：根據預算指標，編制預算草案。預算草案應該包括預算總表、預算明細表、預算說明書等。
5. 審核預算草案：對預算草案進行審核，包括預算指標的合理性、計算的準確性、編制程序的合法性等。
6. 會審預算草案：召開預算會審會議，對預算草案進行審議和討論，形成預算草案的最終版本。
7. 提交預算報告：將預算草案報送行政事業單位的領導機關或審批機關，經過審批后成為正式預算。
8. 實施預算控制：按照預算編制的指標和要求，對單位的財務運行進行控制和監督，確保預算的執行效果。