2010年以來，孝昌縣審計局對全縣新型農村合作醫療基金進行了全面審計，重點審計了新農合基金管理辦公室及14個定點醫療機構，針對存在的問題，提出了整改建議，得到了衛生部門領導的高度重視。最近，該部門領導根據審計報告成立了專門的內審領導小組，對所有的定點醫院進行了全面清理檢查，加大內部監管機制，確保新農合基金安全使用，使農民患者真正得到實惠。

　　一是調整了新農合領導班子，審計結束后，縣政府及衛生部門領導高度重視，調換了新農合“一把手”，將有高等學歷，并有專業技術的年輕院長調到新農合辦公室任“一把手”。

　　二是健全內控制度。孝昌縣財政、衛生部門作為縣新型農合基金的直接管理單位，在基金的核定、征收、使用等環節上，普遍建立了基金管理責任制，使定點醫療機構有章可行，形成各醫院院長直接負責的基金管理格局，并完善了相關監督約束機制和項目基金使用流程，健全和落實了相互監督相互約束的管理制度。

　　三是統一了藥品價格。針對審計發現超標準收取參合農民住院藥品費問題，縣衛生部門及新農合管理部門及時糾正了此類問題，對該縣12個鄉級衛生院和兩家縣級醫院實行了藥品價格限額制，限制藥品價格，規定所有的藥品價格要控制在湖北省藥品采購價格目錄表1%以內。

　　四是加大對業務、會計、報賬人員的專業技術培訓。縣農合辦針對審計查出的不合規報銷醫藥費的問題，立即組織報銷人員及會計人員進行學習培訓，實行了誰核準誰負責，并對大額病人的報銷藥費在本縣廣播電視臺進行公示。并且為各醫療機構購買了電腦，計劃用電腦連網核查進行報銷，確保新型農合基金用到農民患者的手中，讓農民患者得到應得的實惠。