目前，計算機審計在基層審計機關已逐步推廣應用，其作用日益顯現，但隨之出現的問題制約著計算機審計應用的進一步深化，應當引起審計機關的高度重視。

　　一、實際應用方面。最為突出的問題是“學用脫節”，培訓工作做得不少，但大多在閑暇時間，“學得快，忘得也快”，到應用時只有一些零星的記憶。實際應用中，大多仍停留在編寫審計日記、編制審計底稿或證據的初級階段，對于數據查詢分析及抽樣等很少使用。

　　二、人員素質方面。基層審計機關人員的流動性不強，在縣級也就是十來個人，老的審計人員是“半路出家”，掌握一些基礎知識尚可，但是熟練運用相關的數據庫知識和SQL語種句等則較困難，高素質的人才又難以得到，新進一些計算機專業人員又缺乏財務審計知識，無法領會審計人員的意圖和思路，難以形成融洽的溝通。適應計算機審計的人才在基層依舊相當缺乏。

　　三、技術支持方面。目前，雖然很多基層單位都實現了會計電算化，但是使用的數據庫和財務軟件則是五花八門，這些單位的網絡管理人員大多僅僅是機械地使用，采集數據時完全依賴審計人員摸索，費時耗力，往往采集不到理想的數據。另外，在自主研發小型軟件與模塊方面也缺乏技術力量的支持。

　　解決上述問題可以從以下幾個方面著手：

　　一、樹立“學以致用”思想，學用相結合。克服那種周期短、突擊型、照本宣科、淺嘗輒止的培訓模式，培訓學習與實戰演練相結合，拿出實例來演示。下級審計機關要積極參加上級審計機關組織的各種形式的培訓，上級審計機關有目的地從基層審計機關中抽調人員參審上級項目，開拓基層審計人員的視野，提高計算機審計的能力和水平。

　　二、補充“新鮮血液”，培養領軍人。基層審計機關要引進既懂財務基礎知識，又精通計算機知識的人才，將其作為領軍人物加以鍛煉培養，通過示范和帶動，創造一個廣泛的群眾基礎，營造一個良好的應用氛圍。

　　三、加強技術支持，做到與時俱進。首先要做好上下聯動，在軟件與模塊的開發利用方面，上級審計機關給基層審計機關必要的技術支持；其次要完善現有的AO系統等通用審計軟件，解決由于數據接口和模板轉換等帶來的問題，進一步方便數據的采集；第三要在經費上予以大力支持，不僅要保證計算機硬件投入，還要保證必要的培訓學習和軟件開發支出。