國家稅務總局自2003年7月1日開始，將增值稅專用發票稽核系統中“屬于作廢發票” 的采集、稽核比對和協查反饋等有關情況納入考核。從國家稅務總局對全國2004年增值稅專用發票抵扣聯稽核結果的通報看，作廢增值稅抵扣聯比例僅占稽核抵扣聯總數的0.03%―0.04%.雖然作廢增值稅抵扣聯占稽核抵扣聯總數的比例較小，但稽核抵扣聯總數的數量巨大，作廢增值稅抵扣聯絕對值較大，不容忽視。通過我們對企業作廢增值稅抵扣聯的調查和研究，發現由于誤操作而形成的數量占有相當比重，而且對購銷雙方來說，面臨一個比較大的難題，即作廢抵扣聯購貨方已經認證，在銷貨方企業次月自查發現或經稽查部門稽核查實后，購銷雙方應如何進行下一步的規范處理和操作的后續處理，這一難題已經成為稅務機關和納稅人的當務之急。

　　一、作廢增值稅抵扣聯產生的原因

　　主觀原因：

　　一些企業銷售貨物時，在銷售已經實現、增值稅專用發票已經開具、抵扣聯已交給購貨方的情況下，為了達到當月少繳稅的目的，人為進行違規調控，把當月防偽稅控開票子系統中將某筆已經開具的數額較大的專用發票作“作廢”操作。而購貨方對這種情況并不知情，仍按正常程序到稅務機關進行認證，從而產生稽核比對不符。

　　客觀原因：

　　銷售實現后，按照規定進行防偽稅控開票子系統操作，由于誤操作的原因將某筆已經開具的增值稅專用發票在當月防偽稅控開票子系統中進行了“作廢”的操作，而此時購貨方已經將該筆業務抵扣聯通過稅務機關認證系統進行了認證，銷貨方通知購貨方退回此筆專用發票重開已經來不及了，從而產生稽核比對不符。

　　二、作廢增值稅抵扣聯使稅、企購銷三方面對難題

　　對稅務部門來說，面對的是如何處理難題。根據國稅函[2001]730號《國家稅務總局關于金稅工程發現的涉嫌違規增值稅專用發票處理問題的通知》的文件要求，凡屬于增值稅計算機稽核系統發現的涉嫌違規的發票，由稽查部門處理，并不得作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。由于目前稅務機關對作廢抵扣聯發票的處理沒有一個統一的處理依據和規范性處理文件，造成稽查機關對作廢抵扣聯發票的處理各不相同。有的經稽查機關核實雙方業務后允許抵扣；有的則是讓購貨方作進項稅額轉出，做換票處理；有的則是補稅、課征滯納金。

　　對購貨方來說，面對的是到底用不用換票以及怎樣能換回新票的難題。

　　對于銷貨方來說，面對是換票如何開出負數發票難題。由于目前企業普遍使用的是WINDOWS版防偽稅控開票子系統，跨月作廢發票開具不出負數發票沖銷。因此，即便購貨方作廢抵扣聯能夠退回或者到稅務機關辦理《退貨證明單》也是徒勞的，開票系統也開不出負數發票來。

　　三、對誤操作而形成的作增值稅廢抵扣聯如何后續處理

　　由于銷貨方客觀原因造成作廢增值稅抵扣聯，在目前防偽稅控開票子系統開具不出負數發票沖銷的情況下，根據實際工作調查和研究，建議作如下后續處理：

　　1、銷貨方：銷貨方誤操作后，按照國稅函[2003]785號文件“購貨方將專用發票報送稅務機關認證后，銷貨方不得作廢已開具的發票”的精神，銷貨方仍按正常業務計提收入和銷項稅額進行帳務處理，以保證此筆業務的真實性和增值稅鏈條的完整性。

　　2、稅務機關：銷貨方主管稽查稅務機關在接到作廢抵扣聯協查任務、查實銷貨方已將該筆作廢發票進行了計提收入和銷項稅額的帳務處理后，可采取向購貨方稅務稽查機關出示銷貨方已將此筆發票進行了帳務處理書面證明的方式解決；而購貨方主管稽查稅務機關在接到作廢抵扣聯協查任務、查實購貨方已將該筆作廢發票進行了進項稅額等相關科目的帳務處理后，可依據銷貨方稅務機關出具的書面證明，允許購貨方依據此筆發票抵扣進項稅額。但雙方主管稽查稅務機關都要做備案處理。

　　3、購貨方：購貨方報送抵扣聯到稅務機關認證后，就應進行進項稅額等相關科目的帳務處理，即使銷貨方通知此筆發票誤操作作廢，購貨方也仍按照正常業務進行帳務處理，以解決銷貨方不能跨月對作廢的發票開出負數發票來的難題。