生產企業免抵退稅的會計核算，根據業務流程主要可分：免稅出口銷售收入的核算、不予抵扣稅額的核算、應交稅費的核算、進料加工不予抵扣稅額抵減額的核算、出口免抵稅額和應退稅額的核算，以及免抵退稅調整的核算。根據現行會計制度的規定，對出口貨物免抵退稅的核算，主要涉及到“應交稅費——應交增值稅”、“應交稅費——未交增值稅”、“應交稅費——增值稅檢查調整”和“應收出口退稅”。其中“應交稅費——應交增值稅”的借方有“進項稅額”、“已交稅金”、“減免稅金”、“出口抵減內銷產品應納稅額”、“轉出未交增值稅”這5個專欄，貸方設有“銷項稅額”、“出口退稅”、“進項稅額轉出”、“轉出多交增值稅”這4個專欄。需要注意的是這些專欄核算時借貸方是固定的，增加用藍字，減少用紅字。在一般情況下，企業取得主管退稅機關出具的《生產企業出口貨物免抵退稅審批通知書》后，根據上面注明的免抵稅額、應退稅額分別借記“應交稅費——應交增值稅（出口抵減內銷產品應納稅額）”、“應收出口退稅”，根據上面注明的免抵退稅總額貸記“應交稅費——應交增值稅（出口退稅）”。取得主管退稅機關出具的《生產企業進料加工免稅證明》、《生產企業進料加工免稅核銷證明》后，根據上面注明的“不予抵扣稅額抵減額”，紅字借記“主營業務成本”、貸記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額轉出）”。

　　實行“免、抵、退”辦法的企業，購進用于加工出口貨物的材料價款、運雜費等借記“材料采購”科目，按增值稅專用發票上注明的進項稅額借記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額）”科目，按照應付或實際支付的金額貸記“應付賬款”、“應付票據”、“銀行存款”等科目。對可抵扣的運費金額按7%計算的進項稅額，借記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額）”科目，貸記“材料采購”科目。

　　加工貨物出口銷售后，結轉主營業務成本時，借記“主營業務成本”科目，貸記“產成品”科目；企業按規定的增值稅征收率與退稅率之差計算的出口貨物不得免征和抵扣稅額，借記“主營業務成本”科目，貸記“應交稅費——應交增值稅（進項稅額轉出）”科目；用全部進項稅額中剔除出口貨物不得免征和抵扣稅額后的余額去抵減內銷貨物的銷項稅額，即為當期應納稅額或當期留抵稅額。月末對當期應納稅額，借記“應交稅費——轉出未交增值稅”科目，貨記“應交稅費——未交增值稅”；申報入庫時借記“應交稅費——未交增值稅”，貨記“銀行存款”科目。

　　對按規定計算出的當期應退稅額借記“應收出口退稅”科目，當期免抵稅額借記“應交稅費——應交增值稅（出口抵減內銷應納稅額）”科目，按當期計算的免抵退稅額貸記“應交稅費——應交增值稅（出口退稅）”科目，此項會計處理一般是在取得主管退稅機關出具的《生產企業免抵退稅審批通知單》后做。

　　收到稅務機關退回的增值稅稅額借記“銀行存款”科目，貸記“應收出口退稅”科目。

　　生產企業已辦理退稅和免抵稅的出口貨物發生退關、退貨的，應及時到其所在地主管出口退稅的稅務機關申請辦理《出口貨物退運已辦結稅務證明》，交納已退的稅款，調整已免抵稅額。并做相反的會計分錄沖減銷售收入和銷售成本，調整“不得免征和抵扣稅額”。

　　【例】某工業企業生產銷售甲產品。某月購入原材料一批取得的增值稅專用發票上注明的材料價款為40萬元，增值稅額為6.8萬元；本月內銷收入為100萬元，外銷收入按當日市場匯價折合人民幣金額為140萬元。增值稅征收率和退稅率分別為17%和13%，本月已銷產品的生產成本為140萬元，上期留抵稅額12萬元。本月申報所屬期上月的免抵退稅（全部為一般貿易），外銷收入為120萬元。購銷業務均以銀行存款收付。做會計分錄：

　　⑴購入原材料：

　　借：材料采購或原材料                  400 000

　　    應交稅費——應交增值稅（進項稅額） 68 000

　　    貸：銀行存款                           468 000

　　⑵實現銷售收入時：

　　借：銀行存款                                              2 570 000

　　    貸：應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）    （1 000 000×17%）170 000

　　        主營業務收入——內銷                                  1 000 000

　　                    ——外銷                                  1 400 000

　　⑶結轉主營業務成本時：

　　借：主營業務成本——內銷            （1 400 000×40%）560 000

　　                ——外銷            （1 400 000×60%）840 000

　　    貸：產成品                                           1 400 000

　　⑷計算出口貨物不得免征和抵扣稅額，調整出口貨物主營業務成本時：

　　不得免征和抵扣稅額=1 400 000×（17%-13%）=56 000（元）

　　借：主營業務成本——外銷                      56 000

　　    貸：應交稅費——應交增值稅（進項稅額轉出）   56 000

　　⑸計算當期申報的免抵退稅額。應退稅額。免抵稅額時：

　　免抵退稅額＝1 200 000×13%＝156 000（元）＞上期留抵稅額120 000元

　　應退稅額＝120 000

　　免抵稅額＝156 000-120 000＝36 000（元）

　　借：應交稅費——應交增值稅（出口抵減內銷產品應納稅額）36 000

　　    應收出口退稅                                     120 000

　　    貸：應交稅費——應交增值稅（出口退稅）　            156 000

　　⑹計算并繳納當期應稅額：

　　應納稅額=170 000-（68 000-56 000）=158 000（元）

　　借：應交稅費——轉出未交增值稅         158 000

　　    貸：應交稅費——未交增值稅             158 000

　　申報入庫：

　　借：應交稅費——未交增值稅               158 000

　　    貸：銀行存款                             158 000

　　為了避免發生出口企業因補征稅額而發生經營利潤的大起大落，按照權責發生制和配比原則，對出口貨物計算應補征的增值稅按以下方法處理：

　　對補征增值稅稅額中的可退稅部分作為當期的應收債權借記“應收出口退稅”科目，對征退稅率差額部分作為出口成本借記“自營出口銷售成本”（或以前年度損益調整）科目，按補征稅額貸記“應交稅費——增值稅檢查調整”科目。然后對“應交稅費——增值稅檢查調整”科目余額進行處理，借記“應交稅費——增值稅檢查調整”，對補征稅額沖減進項留抵稅額部分貸記“應交稅費——應交增值稅（進項轉出）”科目，對不足沖減應入庫部分貸記“應交稅費——未交增值稅”科目；稅款入庫后，借記“應交稅費——未交增值稅”科目，貸記“銀行存款”科目。

　　在收到退稅機關的補退稅批復后，對賬面數大于批準數的差額，借記“自營出口銷售成本”（或以前年度損益調整）科目，貸記“應收出口退稅”科目。

　　實際收到退稅款后，借記“銀行存款”科目，貸記“應收出口退稅”科目。