我國企業出口商品主要有生產企業自營（委托）出口和通過外貿出口兩種方式，相應地，出口退稅形成了生產企業自營（委托）出口與外貿出口兩種不同的退稅方式。因為生產企業自營（委托）出口與外貿出口計算出口退稅有差異，導致二者稅負有較大區別，納稅人應結合自身情況，盡可能采用稅負低、出口退稅多的出口方式。

　　現行外貿企業出口貨物應退增值稅稅額，依進項稅額計算，具體計算公式為：應退稅額＝購進貨物的進項金額×退稅率；對出口貨物庫存賬和銷售賬均采用加權平均價核算的企業，應退稅額＝出口貨物數量×加權平均進價×退稅率，其退稅依據是外貿企業購進出口貨物的進價。而生產企業自營（委托）出口應退的增值稅是執行“免、抵、退”或“先征后退”，出口退稅的稅額取決于出口的離岸價銷售收入及其進項稅額。

　　企業采用自營（委托）出口，自行辦理出口退稅的形式，同把貨物銷售給外貿企業出口，由外貿企業辦理出口退稅的形式稅負有何差異呢？這兩種形式因為在退稅方面采用不同的退稅方式，由此產生了不同的結果。

　　例如：某中外合資企業A公司生產工業品出口，2000年自營出口20000萬元，可抵扣的進項稅額為1500萬元，該公司自營出口執行先征后退，征稅率為17％，退稅率為13％，年應納增值稅額為：20000×17％－1500＝1900萬元，出口環節應退增值稅：20000×13％＝2600萬元。征稅機關可征增值稅1900萬元，退稅機關應退稅2600萬元，退稅扣減征稅后，該企業實際可得到的稅收補貼為700萬元。

　　假設A公司有關聯外貿B公司，A公司把產品以同樣的價格銷售給B公司，B公司再以同樣的價格銷售到境外，A公司開具增值稅專用發票價稅合計20000萬元，則A公司應納增值稅為：20000÷（1＋17％）×17％－1500＝1406萬元，B公司可得到退稅：20000÷（1＋17％）×13％＝2222萬元。

　　稅務機關征稅1406萬元，退稅機關退稅2222萬元，A、B兩公司實際可得到的稅收補貼為2222－1406＝816萬元。

　　通過以上例子，我們不難發現，同樣的外銷收入，卻產生了不同的結果。從A、B兩公司來看，自營出口實際得到的稅收補貼是700萬元，而通過外貿出口實際得到的稅收補貼是816萬元，兩者相差達到116萬元。顯然，通過選擇出口方式可使企業更加劃算。