為推進國家基本藥物制度改革，錦州市按照“核定任務、核定收支、績效考核補助”原則，制定《錦州市基層醫療衛生機構運行補償機制的指導意見》、《錦州市基層醫療衛生機構實施國家基本藥物制度經費補償實施細則》，逐步建立健全由政府籌資補助基層醫療衛生機構的財政補償機制。包括三方面：

　　一是基本公共衛生服務經費補助。

　　基本公共衛生服務經費補助按照衛生部門核定的任務、服務人口數量及基本公共衛生服務考核結果補助。

　　二是部分醫技診療費補助。

　　實施基本藥物制度后在基層醫療衛生機構就診的城鄉居民發生的縫合、換藥、搶救、X線透視、X線攝影、心電圖、B超、腦電圖、檢驗、手術10項醫技診療費，由醫療保障基金按基層醫療衛生機構實際發生醫技診療費項目、業務量、補助標準進行補助。

　　三是政府辦基層醫療衛生機構收支差額補助。

　　對政府辦基層醫療衛生機構，由基本公共衛生服務經費和基本醫療保障基金及各種專項補助資金補償后，仍有收支差額的，政府通過績效考核由財政專項補助資金給予補助。

　　為確保上述補助政策的落實，目前錦州市各級財政部門共籌措資金53,885萬元，其中：按參加新型農村合作醫療和居民醫療保險人數，人均200元標準籌措資金39,733萬元，按全市人口人均25元標準籌措資金7,791萬元，籌措基層醫療衛生機構實施基本藥物制度綜合改革專項補償資金6,361萬元。