分支機構企業所得稅申報問題，尤其是分攤繳納的計算方法和能否參與就地分攤的問題，一直是企業比較關注的。小編結合實際案例，為您詳細分析分支機構如何計算、繳納企業所得稅。

總機構A公司注冊于南京市，主要從事電子產品的生產、銷售，設立具有主體生產經營職能的部門，且該部門的營業收入、職工薪酬和資產總額與管理職能部門分開核算。A公司于2017年在深圳設立有分支機構B分公司，于2018年在杭州設立有分支機構C分公司，分別適用25%的企業所得稅稅率。

假設2018年度，A公司各個季度匯總計算的實際利潤額均為300萬元，2018年度企業所得稅匯算清繳時，A公司匯總計算的應納稅所得額為1000萬元。

2017年度，各分支機構的營業收入、職工薪酬、資產總額分別為：A公司主體生產經營部門2500萬元、40萬元、1500萬元；B分公司1000萬元、30萬元、1500萬元，合計為3500萬元、70萬元、3000萬元。

分支機構可以分四步計算、繳納企業所得稅。

一、分清需就地分攤繳納企業所得稅的分支機構

根據《國家稅務總局關于印發〈跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法〉的公告》(國家稅務總局公告2012年第57號，以下簡稱57號公告)第四條規定，總機構和具有主體生產經營職能的二級分支機構，就地分攤繳納企業所得稅。其中，二級分支機構，是指匯總納稅企業依法設立并領取非法人營業執照(登記證書)，且總機構對其財務、業務、人員等直接進行統一核算和管理的分支機構。

同時，57號公告第十六條規定，總機構設立具有主體生產經營職能的部門，且該部門的營業收入、職工薪酬和資產總額與管理職能部門分開核算的，可將該部門視同一個二級分支機構。也就是說，可以分攤繳納企業所得稅的二級分支機構有三個：A公司的主體生產經營部門、B分公司和C分公司。

值得注意的是，有五類二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。其中包括：不具有主體生產經營職能，且在當地不繳納增值稅、營業稅的產品售后服務、內部研發、倉儲等匯總納稅企業內部輔助性的二級分支機構;上年度認定為小型微利企業的;當年新設立的二級分支機構;當年撤銷的二級分支機構;匯總納稅企業在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構。由于C分公司為當年新設立分支機構，所以，2018年只有A公司的主體生產經營部門和B分公司，需要就地分攤繳納企業所得稅。

二、各分支機構計算需分攤的比例

根據57號公告第十五條規定，總機構應按照上年度分支機構的營業收入、職工薪酬和資產總額三個因素計算各分支機構分攤所得稅款的比例，三因素的權重依次為0.35、0.35、0.30。

具體計算公式為：某分支機構分攤比例=(該分支機構營業收入÷各分支機構營業收入之和)×0.35+(該分支機構職工薪酬÷各分支機構職工薪酬之和)×0.35+(該分支機構資產總額÷各分支機構資產總額之和)×0.30。

也就是說，2018年度A公司主體生產經營部門分攤比例=2500÷3500×0.35+40÷70×0.35+1500÷3000×0.30=60%；

B分公司分攤比例=1000÷3500×0.35+30÷70×0.35+1500÷3000×0.30=40%。

三、各分支機構按季度預繳納稅

57號公告第六條規定，匯總納稅企業按照《企業所得稅法》規定匯總計算的企業所得稅，包括預繳稅款和匯算清繳應繳應退稅款，50%在各分支機構間分攤，各分支機構根據分攤稅款就地辦理繳庫或退庫；50%由總機構分攤繳納。

也就是說，A公司2018年各季度匯總計算的應納所得稅額=300×25%=75(萬元)，各季度應分攤的所得稅額=75×50%=37.50(萬元)。同時，A公司的各分支機構各季度需分攤的所得稅額=75×50%=37.50(萬元)，按照第一步計算的各分支機構應分攤比例，A公司主體生產經營部門各季度分攤的所得稅額=37.50×60%=22.50(萬元)，B分公司各季度需分攤的所得稅額=37.50×40%=15(萬元)。

整體上來看，A公司總分機構2018年累計預繳的應納所得稅額=75×4=300(萬元)。

四、分支機構根據總機構年度匯算清繳情況，分攤應繳或應退稅額。

根據57號公告第十條規定，匯總納稅企業應當自年度終了之日起五個月內，由總機構匯總計算企業年度應納所得稅額，扣除總機構和各分支機構已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，按照本辦法規定的稅款分攤方法計算總機構和分支機構的企業所得稅應繳應退稅款，分別由總機構和分支機構就地辦理稅款繳庫或退庫。也就是說，在哪里入庫就從哪里退稅。

2018年度，A公司應納所得稅額=1000×25%=250(萬元)，小于A公司總分機構本年累計預繳的300萬元。那么，A公司本年應退的所得稅額=300-250=50(萬元)。A公司所屬分支機構分攤本年應退的總所得稅額=50×50%=25(萬元)，其中，A公司主體生產經營部門應退的所得稅額=25×60%=15(萬元)，B分公司應退的所得稅額=25×40%=10(萬元)。

A公司在完成企業所得稅年度納稅申報時，應填報《跨地區經營匯總納稅企業年度分攤企業所得稅明細表》和《企業所得稅匯總納稅分支機構所得稅分配表》，B分公司需據上表完成當年的企業所得稅年度納稅申報。

《企業所得稅法》第五十條規定，居民企業在中國境內設立不具有法人資格營業機構的，應當匯總計算并繳納企業所得稅。也就是說，如無特殊規定，分支機構應當匯總申報企業所得稅，屬于法理規定，不具備選擇性。

設立有分支機構的企業，應加強對57號公告的學習理解，按規定梳理出需就地分攤繳納企業所得稅的分支機構，由總機構在主管稅務機關將需匯總分支機構做匯總納稅信息備案后，分支機構再憑備案表到主管稅務機關做企業所得稅信息維護。

值得注意的是，57號公告主要闡述跨地區(跨地區，指的是總分機構不在同一省、自治區、直轄市和計劃單列市)總分機構的計算繳納申報規定。

小編提醒，未跨地區設立分支機構的企業，還需關注所在地區稅務部門制定的具體辦法。

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