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總分機構匯算清繳怎樣做？
有些公司是總分機構的形式，分公司獨立核算（收入、成本、利潤），領取了非法人營業執照，進行了納稅登記。這種形式下的企業所得稅應該如何匯算清繳呢？是季度分別預交，然后年度由總公司匯算清繳？還是分別進行匯算清繳？
總、分機構企業所得稅實行按月或按季申報，就地預繳。
總機構應將統一計算的企業當期應納企業所得稅額，按核定的分配比例，計算總機構和各分支機構當期應納稅額，由總機構和分支機構分別向所在地主管稅務機關辦理納稅申報。
各分支機構不進行企業所得稅匯算清繳，統一由總機構按照相關規定進行。
總機構根據匯總計算的企業年度全部應納稅額，按規定的分攤比例，計算總機構和各分支機構的應納企業所得稅額，扣除各自已預繳的稅款，分別由總機構和分支機構多退少補。
分析：
依據《中華人民共和國企業所得稅法》第五十九條第二款規定，居民企業在中國境內設立不具有法人資格的營業機構的，應當匯總計算并繳納企業所得稅。如果是設立的分公司，分公司不具有法人地位，而依據新的企業所得稅法規定，企業所得稅實行法人所得稅制，所以需要按規定匯總計算并按規定繳納企業所得稅。
根據《跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法》的規定：
一、居民企業在中國境內跨地區（指跨省、自治區、直轄市和計劃單列市，下同）設立不具有法人資格分支機構的，該居民企業為跨地區經營匯總納稅企業（以下簡稱匯總納稅企業），除另有規定外，其企業所得稅征收管理適用本辦法。
二、匯總納稅企業實行“統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫”的企業所得稅征收管理辦法：
（一）統一計算，是指總機構統一計算包括匯總納稅企業所屬各個不具有法人資格分支機構在內的全部應納稅所得額、應納稅額。
（二）分級管理，是指總機構、分支機構所在地的主管稅務機關都有對當地機構進行企業所得稅管理的責任，總機構和分支機構應分別接受機構所在地主管稅務機關的管理。
（三）就地預繳，是指總機構、分支機構應按本辦法的規定，分月或分季分別向所在地主管稅務機關申報預繳企業所得稅。
（四）匯總清算，是指在年度終了后，總機構統一計算匯總納稅企業的年度應納稅所得額、應納所得稅額，抵減總機構、分支機構當年已就地分期預繳的企業所得稅款后，多退少補。
三、總機構和具有主體生產經營職能的二級分支機構，就地分攤繳納企業所得稅。二級分支機構，是指匯總納稅企業依法設立并領取非法人營業執照（登記證書），且總機構對其財務、業務、人員等直接進行統一核算和管理的分支機構。
三、以下二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅：
（一）不具有主體生產經營職能，且在當地不繳納增值稅、營業稅的產品售后服務、內部研發、倉儲等匯總納稅企業內部輔助性的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。
（二）上年度認定為小型微利企業的，其二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅。
（三）新設立的二級分支機構，設立當年不就地分攤繳納企業所得稅。
（四）當年撤銷的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業所得稅。
（五）匯總納稅企業在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。
根據對以上內容的了解，相信大家對于總分機構的企業所得稅的管理應該有個清晰的認識了。
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