在權益法下處理投資時，如果被投資單位發生虧損，并且這種虧損超出了投資者原先記錄的對該被投資單位的投資成本，即產生了超額虧損。這種情況對合并財務報表的影響主要體現在以下幾個方面：

首先，從母公司單獨報表的角度來看，在超額虧損的情況下，母公司需要將賬面上該項長期股權投資的價值減記至零。如果還有未彌補的虧損，則這部分虧損不再沖減長期股權投資的成本，而是作為一項備忘項目在財務報表附注中披露。

其次，在編制合并財務報表時，對于超額虧損的處理方式會有所不同。根據會計準則的規定，當子公司出現超額虧損時，并不意味著母公司應該立即確認所有剩余未分配給母公司的虧損。相反，母公司首先應當沖減其在子公司中的權益（即長期股權投資），如果還有超出部分，則可以考慮沖減母公司對子公司的其他實質性的長期利益或者按比例承擔這部分虧損，但最終不應導致合并財務報表中少數股東權益出現負數。

需要注意的是，在實際操作過程中，對于超額虧損的具體處理方法可能會因國家或地區的會計準則差異而有所不同。例如，某些國家可能允許在特定條件下將超額虧損直接計入當期損益；而在其他情況下，則要求通過調整所有者權益來反映這部分虧損。

總之，在合并財務報表中正確地反映出超額虧損的影響是非常重要的，這不僅關系到母公司和子公司之間的經濟利益分配問題，也直接影響著外部投資者對公司整體財務狀況的理解。