納稅人的權利保護在稅務訴訟中有著重要的體現，這不僅關乎到稅收法制的完善和公平正義的實現，也是構建和諧征納關系的基礎。首先，在程序法方面，《中華人民共和國行政訴訟法》明確規定了納稅人享有起訴權、申請回避權、委托代理人參加訴訟的權利等，這些規定確保了納稅人在稅務爭議解決過程中能夠平等地參與并維護自身權益。

其次，從實體法角度來看，《稅收征收管理法》及其實施細則中對納稅人的權利也進行了詳細的規定。例如，納稅人有權要求保密其商業秘密和個人隱私；在稅務機關作出具體行政行為時，如果該行為依據的規范性文件不合法或適用法律錯誤，納稅人可以請求法院一并審查相關文件；當稅務機關采取強制執行措施時，必須嚴格遵守法定程序，并且不得超出必要的限度損害納稅人的合法權益。

此外，在實際操作層面，為了更好地保護納稅人的權利，我國還建立了一套較為完善的救濟機制。比如設立專門的稅收爭議調解機構、提供行政復議途徑以及允許納稅人依法提起訴訟等。這些措施為解決稅務爭議提供了多樣化的選擇，有助于及時有效地化解矛盾糾紛。

總之，通過法律法規的規定和具體實踐中的制度安排，納稅人的權利在稅務訴訟中得到了充分的保護，這對于促進稅法遵從度提高、維護市場經濟秩序具有重要意義。