農產品進項稅額抵扣的比例是按照國家規定的稅率來計算的。在中國，農產品適用的是9%的增值稅稅率。因此，如果企業購進農產品用于生產或者委托加工13%稅率的貨物，那么在計算進項稅額時，可以按照購進農產品價格的9%來計算抵扣。

例如，如果企業購進農產品支付的價格為100萬元，那么可以抵扣的進項稅額為：

100萬元 * 9% = 9萬元

這個9萬元可以用來抵扣企業應繳納的增值稅。如果企業生產的貨物適用13%的稅率，那么在銷售這些貨物時，需要按照貨物銷售額乘以13%的稅率來計算應繳納的增值稅。如果企業當期的進項稅額（包括農產品進項稅額和其他進項稅額）足夠大，可以完全抵扣應繳納的增值稅，那么企業實際上不需要繳納增值稅。如果進項稅額不足以完全抵扣，企業需要繳納差額部分的增值稅。