股票期權個稅計算中，多次行權的情況需要根據個人所得稅法的相關規定進行處理。通常，每次行權都應作為一個獨立的納稅事件來處理，并按照以下步驟進行計算：
1. 確定行權收入：首先，需要確定每次行權所獲得的收入。行權收入是指行權時股票的市場價格與行權價格之間的差額。如果行權時股票的市場價格高于行權價格，則行權收入為正數；如果行權價格高于市場價格，則行權收入為負數（即損失）。
2. 判斷納稅義務：根據個人所得稅法的規定，員工取得股票期權時，并不是所有的人都立即產生納稅義務。只有當員工實際行權時，才需要按照工資、薪金所得項目計算繳納個人所得稅。
3. 計算應納稅所得額：對于行權收入為正數的情況，需要按照工資、薪金所得項目計算應納稅所得額。應納稅所得額 = 行權收入 - 費用（如有）。費用包括員工取得和行權時實際發生的合理稅費。
4. 適用稅率表：根據最新的個人所得稅稅率表，確定應納稅所得額對應的稅率及速算扣除數。
5. 計算應納稅額：使用稅率表計算應納稅額，應納稅額 = 應納稅所得額 × 適用稅率 - 速算扣除數。
6. 多次行權的累加計算：如果員工多次行權，則需要將每次行權的應納稅額累加起來，得到總的應納稅額。
7. 申報納稅：員工需要將累加后的應納稅額按照個人所得稅法的規定進行申報納稅。

需要注意的是，股票期權個稅計算中可能會涉及到特殊情況，如非上市公司股票期權、限制性股票等，這些情況下稅法可能有特定的規定，需要根據實際情況和稅法具體規定進行處理。建議在處理多次行權的情況時，咨詢稅務專業人士以確保合規性。