非居民企業股權轉讓特殊性稅務處理中的稅務清算，是指在股權轉讓交易中，如果非居民企業適用特殊性稅務處理政策，則需要在交易完成時進行稅務清算，以確定是否需要繳納企業所得稅。特殊性稅務處理政策通常包括免稅、減稅或遞延納稅等優惠措施。

根據中國稅法的規定，非居民企業股權轉讓的特殊性稅務處理主要包括以下幾種情況：
1. 免稅處理：如果非居民企業轉讓中國居民企業的股權，且取得的收益屬于免稅收入，如股息、紅利等，則不需要進行稅務清算。
2. 遞延納稅處理：如果非居民企業轉讓中國居民企業的股權，且符合一定條件（如投資年限、持股比例等），可以享受遞延納稅的優惠，即在轉讓股權時不需要立即繳納企業所得稅，而是可以在未來某個時間點繳納。在這種情況下，需要進行稅務清算，計算應納稅所得額，并將其記錄在企業的稅務賬戶中，待未來納稅時使用。
3. 一般性稅務處理：如果非居民企業轉讓中國居民企業的股權，且不符合特殊性稅務處理條件，則需要按照一般性稅務處理辦法進行稅務清算。此時，需要計算股權轉讓所得，并按照企業所得稅稅率繳納企業所得稅。

在進行稅務清算時，非居民企業需要準備以下資料：

- 股權轉讓合同或協議；
- 股權轉讓收入；
- 被轉讓企業的資產負債表、利潤表等財務報表；
- 非居民企業及其直接或間接控制股東的稅收居民身份證明文件；
- 其他相關證明文件和資料。

非居民企業應根據上述資料，按照中國稅法規定計算股權轉讓所得，并據此確定是否需要繳納企業所得稅。如果需要繳納，應按照規定的時間和方式申報納稅。如果適用遞延納稅政策，則應按照稅務機關的要求，定期匯報相關情況并履行其他必要的稅務義務。