根據稅法的規定，房地產開發經營業務費用可以按照以下方式進行扣除：
1. 直接費用扣除：直接與房地產開發經營業務相關的費用，例如土地使用權出讓金、建設工程費用、房屋租賃費用等，可以在當期扣除。
2. 間接費用分攤扣除：間接與房地產開發經營業務相關的費用，例如管理費用、銷售費用、財務費用等，需要按照合理的分攤方法進行扣除。一般可以采用以下兩種分攤方法：
   - 比例分攤法：根據房地產開發經營業務收入與總收入的比例，將間接費用按比例分攤到房地產開發經營業務上。
   - 直接分攤法：根據實際發生的間接費用與房地產開發經營業務直接相關的費用之間的比例，將間接費用分攤到房地產開發經營業務上。

需要注意的是，費用的扣除必須符合稅法的規定，且必須有相關的憑證和合法的發票。同時，扣除的費用必須與真實的經濟業務相符，并符合合理的商業習慣。具體的扣除方法和要求可以根據稅法的規定和實際情況進行具體操作。建議在實際操作中咨詢專業稅務人員的意見，以確保合規性。