函證程序是審計中常用的一種程序，通過函證程序，審計師可以直接向第三方（例如客戶的供應商、債權人或債務人）發送函函詢問相關的財務信息或者確認某些事實。然而，函證程序也存在一些限制，包括：
1. 受限于第三方的配合：第三方可能不愿意或者無法提供審計師需要的準確信息。有些第三方可能拒絕回應函證函，或者提供不完整或有誤導性的信息。
2. 有可能受到誤導：第三方可能提供虛假信息，或者選擇性地回應函證函，從而導致審計師得出錯誤的結論。
3. 成本和時間限制：函證程序可能需要耗費大量的時間和資源，尤其是在需要發送大量函證函的情況下。審計師需要權衡成本與效益，以確定是否值得進行函證程序。
4. 依賴性：審計師對第三方提供的信息的準確性和完整性有一定程度的依賴性，可能無法完全保證信息的真實性。

因此，審計師在進行函證程序時需要謹慎對待，并結合其他審計程序進行綜合分析，以確保審計工作的準確性和可靠性。