在合并財務報表中，如果公司取得的子公司不屬于同一控制下，即非同一控制下取得的子公司，應按照以下步驟處理其凈資產：
1. 識別非同一控制下取得的子公司：首先，需要確定該子公司是否屬于非同一控制下取得。非同一控制下取得的子公司是指公司通過購買股權或其他方式取得的，但無法對該子公司進行直接或間接控制的子公司。
2. 采用權益法核算：對于非同一控制下取得的子公司，應采用權益法核算。根據權益法，公司將其在該子公司的投資按照成本計量，并將其在該子公司的凈利潤或凈虧損按比例計入合并財務報表中。
3. 調整合并財務報表：在合并財務報表中，需要進行相應的調整來反映非同一控制下取得的子公司的影響。具體調整包括：
   - 從合并財務報表中排除非同一控制下取得的子公司的資產、負債、收入和費用等項目；
   - 將非同一控制下取得的子公司的凈利潤或凈虧損按比例計入合并財務報表中的投資收益或投資損失項目；
   - 調整合并財務報表中的相關指標，如資產總額、負債總額、凈資產等。

需要注意的是，合并財務報表中處理非同一控制下取得的子公司的凈資產是一個復雜的過程，需要根據具體情況進行判斷和處理，建議在處理過程中咨詢專業會計師的意見。