民間非營利組織在核算投資收益時，需要遵循以下步驟：
1. 確定投資類型：民間非營利組織可能投資于股票、債券、房地產等不同類型的資產。首先，需要確定投資的具體類型。
2. 記錄投資成本：在購買投資資產時，需要記錄投資的成本。這包括購買資產的金額以及與投資相關的費用，如傭金和手續費。
3. 確定投資收益：投資收益可以是股息、利息、房地產租金或資產升值等形式。根據投資類型和收益來源，確定投資收益的金額。
4. 記錄投資收益：將投資收益記錄在會計憑證中。根據會計原則，投資收益通常被認為是非營利組織的一種收入，應該在財務報表中進行披露。
5. 財務報表披露：將投資收益在財務報表中進行披露。通常，投資收益會被列入非營利組織的綜合收益表或利潤表中。

需要注意的是，投資收益的核算可能會受到特定的會計準則和法規的影響。因此，在核算投資收益時，民間非營利組織應該遵守當地的會計準則和法規，并與專業會計師或財務顧問合作，以確保準確和合規的核算。