上市公司組織機構的特別規定對公司治理有以下幾個方面的影響：
1. 獨立董事制度：上市公司組織機構的特別規定通常要求上市公司設立獨立董事，以增加公司決策的獨立性和公正性。獨立董事具有獨立的地位和權力，能夠對公司的經營決策進行監督和審查，保護股東利益，維護公司治理的穩定性。
2. 董事會結構：上市公司組織機構的特別規定可能對董事會的結構和組成進行規定，例如要求董事會中必須有一定比例的獨立董事、員工代表董事等。這些規定可以增加董事會的多元化和代表性，提高公司治理的效能和公正性。
3. 監事會設立：上市公司組織機構的特別規定可能要求上市公司設立監事會，監督公司的經營活動和財務狀況。監事會可以獨立于董事會進行監督和審計，增加公司治理的透明度和有效性。
4. 公司章程規定：上市公司組織機構的特別規定通常要求上市公司制定公司章程，明確公司治理的原則和規定。公司章程可以規定董事、監事和高級管理人員的任職條件和權責，明確公司治理的程序和機制，為公司的經營和決策提供依據和指導。

綜上所述，上市公司組織機構的特別規定對公司治理起到了重要的引導和規范作用，有助于提高公司治理的透明度、公正性和有效性，保護投資者利益，維護市場秩序。