長期借款的保護性條款是為了保護借款人和貸款人的利益而設立的。當借款人違約時，保護性條款可以起到以下作用：
1. 提供違約處理程序：保護性條款通常包括了借款人違約的定義和違約后的處理程序。這有助于明確雙方在違約情況下應該采取的行動，以保護貸款人的權益。
2. 規定違約責任：保護性條款可以規定借款人在違約情況下應承擔的責任和后果。這有助于確保借款人在違約時能夠按照約定承擔相應的法律責任。
3. 加強貸款人的權利：保護性條款通常會賦予貸款人一定的權利，例如要求借款人提供額外的擔保或者加大借款人的還款義務。這有助于貸款人在借款人違約時更好地保護自身的權益。

總的來說，長期借款的保護性條款在借款人違約時的作用是確保雙方能夠在合同規定的框架內進行處理，并保護貸款人的利益。