當有限責任公司的股東退出公司后，其股權可以通過以下幾種方式進行處理：
1. 股權轉讓：股東可以將其股權轉讓給其他股東或第三方。轉讓的具體方式可以根據公司章程或協議進行約定，通常需要經過其他股東的同意或公司的批準。
2. 股權回購：公司可以自行回購股東退出的股權，以減少公司的股東數量或增加其他股東的持股比例。回購的具體方式可以根據公司章程或協議進行約定。
3. 股權轉換：如果公司有其他類別的股權，例如優先股或特權股，股東退出后，其股權可以被轉換成其他類別的股權。
4. 股權分割：股東退出后，其股權可以被分割成多份，分配給其他股東或新加入的股東。

無論采取何種方式處理股權，都需要遵守相關的法律法規和公司章程的規定。在進行股權轉讓或回購時，還需要注意是否需要履行相關程序，如報備或公告等。同時，公司應及時更新公司股權登記簿，確保股權變動的準確記錄。