3%和9%都可以開專票嗎？

是都可以開專用發票

這種即選擇了簡易計稅3%又有一般計稅9%，進項稅如何抵扣呢？

一個業務沒法選擇兩個稅率

也就是說，一個甲供工程業務不可以即按簡易計稅3%又按一般計稅9%，只能選擇其中一種，對嗎？但合同里約定了兩個稅率，咋辦？

是的，您的理解非常正確，那就修改一個

謝謝老師的建議！

客氣，非常榮幸能夠給您支持