單位自查補稅一般沒有固定比例控制。補稅金額主要取決于企業實際的稅務違規行為或未正確申報納稅的情況，如少計收入、多列成本等實際的應補稅金額核算結果來確定。稅務機關重點關注的是企業自查是否徹底、補稅是否真實完整符合規定。